4月20日，联合舰队在海军大学反复举行了图上作业演习之后，所有参加突袭作战的舰艇，完全按照突袭计划，以集结在佐伯湾的联合舰队主力战列舰为目标，进行最后的一次综合攻击演习，作为战前训练的检验。山本通过这些演习认为攻击效果良好，已经达到了训练目的，参战部队总结演习经验，返回各自基地，进行最后的出发准备。
4月25日，所有参战舰艇的舰长和飞行军官，一起研讨作战方案中的关键问題。4月27日，所有飞行员在珍珠港的沙盘模型上明确各自的任务。
为了做到知己知彼，日军在收集美军情报上下了很大功夫。自1941年5月后，派到珍珠港的日本间谍多达200人，从各方面搜集珍珠港的天气、水文、地形和美军基地、飞机、舰艇的部署。特别要提到日本海军情报部的吉川猛夫少佐，经过八个月的培训，以森村正的化名，于1941年3月作为日本驻檀香山领事馆参赞來到珍珠港，进行情报搜集。然后将情报以外交密码发回外务省再转海军。他发回的情报从最初的每周一次发展到最后每日一次，为日本海军提供了大量有价值的情报，其中包括：美军在不同日子的舰艇停泊情况和活动情况，珍珠港美军飞机的机种和数目，珍珠港的防空设施等。
为了得到北航线的实际情况，日军于10月派出两批共4名军官，化装成商人或水手，搭乘经北航线的船只赴檀香山，实地考察北航线的气象、海情及航道情况。除了派遣间谍获取情报外，日军还加强对夏威夷广播和电讯的监听。经过这些努力，在开战前，日军已准确掌握了美军在珍珠港的防御设施、兵力部署、舰艇和飞机的种类数量、驻泊停放情况、美军的活动规律等情报。
为了确保偷袭的突然『性』，日军还采取了一系列的战略欺骗和伪装。首先，以和谈作为掩护。早在1941年2月，日本方面就任命退役海军上将，美国总统罗斯福的朋友，著名的亲英美人士野村吉三郎为驻美大使。他在担任驻美大使期间与美国官员的会谈多达数十次。去年7月，近卫首相就曾经致信罗斯福，表示两国间沒有不能用谈判解决的问題，并保证绝不侵犯英美在东南亚的利益。去年11月5日，日本大本营还派出曾任驻美领事，娶美国人为妻的公认亲美派人士來栖三郎为和平特使，赴美进行第一轮谈判。抗战之铁血佣兵70
其次，从1941年7月日方开始和苏联秘密接触开始，日本关东军开始陆续扩编，从11个师40万人增加到20个师70万人，并制定了代号为“关特演”的大规模演习，制造进攻苏联的假象，掩盖对美国的作战准备。41年10月，在日本内海组织登陆演习，还邀请各国驻日武官参观，以吸引各国
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